“五大藏”的缘起：丁卯年（1867年）十一月初一，钦则大师应邀前来，在为工珠大师的洋楚禅院举行开光仪式时，突然平庸的境界消失，升起了无边的清净佛国土的显现，出现一巨大的佛塔。塔四周各有四门，里面有五大库藏，每一库藏中，都充满了法宝。里面有许多智者成就者，正向大师招呼示意，大师逐一巡视了每一库藏中法集的内容，并牢记于心中。后来，钦则大师写出了每一藏的提纲目录，交给工珠大师，并一再激励工珠大师编著，即成为史无前例的集西藏佛教和传统文化之大成的划时代著作：《佛教显密诸宗及藏族文化总释》，《窍诀教导藏》，《口传密咒藏》，《不共秘密藏》，《大宝伏藏》等著名的五大藏。

《显密诸宗及藏族文化总释》又名为《所知藏》或《知识总汇》，全名《诸乘总摄•经教大宝藏三学善说论•周遍所知》。

此书代表了西藏佛学的最高成就，书中详细地阐述了原始佛教、大乘佛教、秘密金则乘的历史、教义，显密经续论典的要义，西藏各教派在闻、思、修、果等方面的主张和特征，乃至梵藏语言文字（声明）、逻辑推理知识和认识论（因明），工艺美术技艺（工巧明），身心的养育、延年、益寿治疗疾病（医方明），以及修辞、辞藻学、声律学、歌舞、天文历算（五山明）等藏族所有共同传统文化的来源，传授方式、要义，有何需要等内容的一部百科全书式的百万言的巨著。

此书被盛赞为：“一切书中最优秀的，是求知者的智慧海洋，思维者的心灵之舟，观修者的密决大宝，研究者的明镜”。此书是通向解脱和成佛的道路，是打开佛教和藏族传统文化宝库之钥匙，是能满足各种追求者和爱好的如意宝。

《窍诀教导藏》共十八函（德格版），此藏汇编了西藏大小各修传派的灌顶、教诫、传承、修持窍诀的精义，总括了西藏祖师所传的各种心地法门和本尊坛城，以及气脉明点拙火等方便法门。

《口传秘密藏》主要有新译密派马尔巴译师所传承的胜乐、喜金刚、密集为主的无上续部的灌顶、教诫、修行、坛城的本续和解释以及部分早译密派的金刚橛等法类。

《不共秘密藏》是由大师本人所发掘的《三根本密意集》、《秘密心要父教母教》等地伏藏等法集汇编而成。

《大宝伏藏》此藏共有六十三函，该书精选汇聚了从十一世纪初，西藏第一伏藏师桑杰喇嘛，到近代最伟大的伏藏师班马威色多昂领巴（钦则大师）和曲久领巴之间，近二百位西藏秘教伏藏大师的各种精华教诫和密法集。

此书内容博大精深，包括有非常珍贵的古代藏族及印度秘教历史，各位伏藏大师之生平简介的史料。
书中详述了天文历算、星相、占卜、炼丹、变金术、医方医学，延生术、摄生僻谷术；佛国土、天界、地狱等其它各种生命世界的漫游和回忆录；灵魂的死亡、转生投胎过程；剑仙、丸药、神行、金丹、飞行、隐身、土遁等各种世间成就的修法；各种愤怒、寂静本尊护法的成就法；平息灾难、增益智慧、勾召统制他人、咒杀妖魔等各种事业的修法；有关组成身体的本质：气、脉、明点、拙火等理论和修法；有关心的实相的教义和大中道、大手印、大圆满（心部、界部、窍决部）的修持窍诀等等法门，无所不包，应有尽有。
此著作中所代表的是，伟大的藏民族在数千年的历史中，在原始本教的丰实文化基础上，不断吸收了南亚、西亚、中亚和中原华夏文明，并经历代最优秀、最杰出的藏族人士，将他们所有的情感、意志、智慧和生命，全部投入对宇宙和生命的探索之中，所获得的有关人类求索的历史。（秘教史），宇宙和生命的本质、起源、演化，精神和物质的统一和巨变关系，人和宇宙的关系，人类如何才能超越自己，而成为一种更高的生命形式，以及他们在探求奥秘的过程中，不断创造发展的古代科学技术。

在当代，西方国家的自然和社会科学的专家学者教授，纷纷掀起了以西藏为代表的藏学研究热潮。以上五大藏连同大师的其他佛学，医学、历史、文学等著作略有一百多函。